نوع مقاله : مقاله پژوهشی
نویسندگان
1 دانشجوی سابق دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
2 دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
3 استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
4 استاد، گروه علوم باغبانی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
5 استاد بخش علوم گیاهی مرکز تحقیقات کشاورزی و شیلات بلژیک
چکیده
در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 21 تودۀ موسیر (Allium hirtifolium Boiss.) وحشی ایران از مناطق جنوب، جنوب غرب، غرب و مرکز ایران با استفاده از صفات مورفولوژیکی و نشانگرهای AFLP ارزیابی شد. نتایج نشان داد تودۀ خوانسار دارای بیشترین عرض برگ (42/5 سانتیمتر)، میانگین تعداد برگ در بوته (41/5)، قطر سوخ (84/10 سانتیمتر)، ارتفاع سوخ (95/4 سانتیمتر) و وزن متوسط سوخ (5/122گرم) بود و بنابراین، تودۀ مناسبی برای اهلیسازی و کشت است. براساس تجزیۀ کلاستر تودههای مطالعهشده از نظر صفات مورفولوژیکی در سه گروه قرار گرفتند که تا حد زیادی براساس نزدیکی و دوری جغرافیایی بود. در بررسی مولکولی توسط نشانگرهای AFLP از چهار ترکیب آغازگری EcoRI و MseI دارای سه نوکلئوتید انتخابی استفاده شد. در آنالیز مولکولی، 376 نشانگر حاصل شد که 204 نشانگر (28/53 درصد) چندشکلی نشان دادند. براساس دندروگرام حاصل از دادههای مولکولی، تودههای موسیر بومی ایران در حد تشابه 70 درصد در پنج گروه قرار گرفتند که مطابقت زیادی با پراکنش جغرافیایی آنها نشان داد. همچنین تودۀ کازرون از منطقۀ گرمتر جنوبی با تودههای شمالیتر که از مناطق سردتر بوند تفاوتهای ژنتیکی بارزتری داشت. نتایج نشان داد تکنیک AFLP ابزار مناسبی در ارزیابی تنوع ژنتیکی تودههای موسیر ایرانی است.
کلیدواژهها
عنوان مقاله [English]
Genetic study of Persian shallot (Allium hirtifolium Boiss.) using morphological and molecular markers
نویسندگان [English]
- Rahele Ebrahimi 1
- Mohammad Reza Hassandokht 2
- Zabih-o-lah Zamani 3
- Abd-olkarim Kashi 4
- Izabel Roldan-Ruiz 5
1 Former Postgraduate Student, University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran
2 Associate Professor, University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran
3 Professor, University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran
4 Professor, University College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran
5 Institute for Agricultural and Fishers Research (ILVO), Plant Sciences Unit, Caritasstraat 21, 9890 Melle, Belgium
چکیده [English]
In this research work, genetic diversity of 21 wild Persian shallot (Allium hirtifolium Boiss.) accessions from south, southwest, west and center of Iran was evaluated using morphological traits as well as AFLP markers. Results showed that Khansar accession had the highest leaf width (5.42 cm), mean leaf number per plant (5.41), bulb diameter (10.84 cm), bulb height (4.95 cm) and mean bulb weight (122.5 g) which was the suitable accession for domestication and culturing. Based on cluster analysis, studied accessions were divided into three groups according to their morphological characters which mostly had coincidence with geoghraphical distribution. Molecular survey by AFLP markers was done using four primer combinations of EcoRI and MseI with three selective nucleotides. In molecular analysis 376 bands were obtained in which 204 bands were polymorphic (53.28%). Based on dendrogram from molecular data, Persian shallot accessions at 70 % similarity was divided into five groups which mostly showed coincidence with geographical distribution. Also Kazerun accession from warmer southern region of Iran had obvious genetical differences with accessions from colder northern regions. Results showed that AFLP technique is a suitable tool for evaluation of genetic diversity for Persian shallot accessions.
کلیدواژهها [English]
- AFLP
- Genetic diversity
- Landrace
- Cluster Analysis
- domestication