ارزیابی الگوی پروتئین‌های ذخیره‌ای بذر در خشخاش ایرانی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

2 Department of Agriculture, Payame Noor University, Tehran, Iran

چکیده

خشخاش ایرانی (Papaver bracteatum) به عنوان یک گیاه دارویی با قابلیت تولید آلکالوئید تبائین، در مناطق خاصی از ایران رشد می‌کند. این آزمایش با هدف شناسایی بهترین روش استخراج پروتئین و بررسی تنوع ژنتیکی 18 جمعیت از خشخاش ایرانی (Papaver bracteatum) که از مناطق مختلف ایران جمع‌آوری‌شده بودند به همراه یک نمونه کنترل Papaver somniferum با استفاده از الگوی الکتروفورزی پروتئین بذر انجام شد. نتایج نشان داد که روش استخراج پروتئین با استفاده از فنل بهترین نتیحه را ارائه می‌دهد. همچنین الگوی باندها پس از رنگ‌آمیزی با کوماسی بریلیانت بلو G250 وضوح بالاتری داشت و دقت بیشتری در ردیابی باندهای پروتئینی فراهم کرد. با مقایسه الگوی الکتروفورز باندهای پروتئینی تعداد 68 نوار با وزن مولکولی در دامنه 120-13 کیلودالتون مشاهده گردید. کمترین و بیشترین تعداد باند به ترتیب در جمعیت P2 (سد لار البرز) و P17 (منطقه پل زنگوله البرز) مشاهده شدند. بیشترین فاصله بین دو جمعیت P15 و P7 به ترتیب از دو منطقه البرز روستای یوش‌بلده و کردستان روستای پیرعمران ثبت گردید. با استفاده از الگوی الکتروفورز پروتئین بذر دو گونه bracteatum P. و somniferum P. بخوبی از هم تفکیک شدند. تجزیه خوشه‌ای به روش UPGMA و ضریب تشابه دایس انجام شد و جمعیت‌های مورد مطالعه در پنج گروه مجزا تفکیک گردیدند. نتایج این بررسی نشان‌دهنده تاثیر کم منطقه جغرافیایی بر شباهت جمعیت‌ها و گروه‌بندی آنها است، بنابراین الگوی الکتروفورز پروتئین بذر قادر است برای جداسازی و شناسایی جمعیت‌های مختلف این گونه در برنامه‌های حفاظت مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Evaluation of seed storage proteins profile in Papaver bracteatum

نویسندگان [English]

  • soheila afkar 1
  • zahra akbari 2
1 Agriculture Department, Payame Noor University, Tehran, Iran
2 Department of Agriculture, Payame Noor University, Tehran, Iran
چکیده [English]

The Iranian poppy (Papaver bracteatum) is a medicinal plant known for its ability to produce the alkaloid tebaine and grows in specific regions of Iran. This study aimed to identify the optimal protein extraction method and investigate the genetic diversity of 18 populations of Iranian poppy collected from various parts of Iran, along with a control sample of Papaver somniferum, using seed protein electrophoresis patterns. The results indicated that the protein extraction method utilizing phenol yielded the best results. Additionally, after staining with Coomassie Brilliant Blue G250, the band patterns displayed higher clarity and provided greater precision in tracking protein bands. A total of 68 bands were observed within a molecular weight range of 120-13 kDa when comparing electrophoresis patterns. The least and most number of bands were recorded in populations P2 (Lar Dam, Alborz) and P17 (Pol Zanguleh region, Alborz), respectively. Genetic similarity among the studied populations varied significantly, ranging from 0.4 to 0.8. The greatest distance was noted between populations P15 and P7 from two different regions: Yush-Baladeh village in Alborz and Pir-Imran village in Kurdistan. Seed protein electrophoresis effectively distinguished between species P.bracteatum and P.somniferum. Cluster analysis using UPGMA method along with Dice similarity coefficient revealed five distinct groups among the studied populations. The findings suggest that geographic location has minimal impact on population similarity and their clustering; therefore, seed protein electrophoresis can be utilized for isolating and identifying different populations of this species in conservation programs.

کلیدواژه‌ها [English]

  • SDS-PAGE
  • electrophoresis pattern
  • protein extraction method
  • genetic diversity
  • papaver bracteatum