@article { author = {Yosefi, Maryam and Mohsenzadeh, Mohammad and Samizadeh Lahiji, Habibollah}, title = {Assessment of genetic diversity in‏ ‏Corylus avellana L. by ISSR marker and ‎retrotransposon in Amlash region}, journal = {Iranian Journal of Horticultural Science}, volume = {53}, number = {2}, pages = {465-477}, year = {2022}, publisher = {University of Tehran}, issn = {2008-482X}, eissn = {2423-7930}, doi = {10.22059/ijhs.2021.320719.1909}, abstract = {In this study, the genetic diversity of 63 hazelnut genotypes was evaluated using 10 ISSR primers, two retrotransposon markers and seven combined ISSR and retrotransposon primers, which of the seven combined primers, only three showed scorable bands and other primers did not form a band. The 15 primers used in this study were able to create a total of 116 polymorphic bands. The UBC822 produced the highest number of polymorphic bands with 14 bands, the UBC814 with 3 bands had the least number of bands. The polymorphic information content and marker index of primers ranged from 0.18 to 0.44 as well as 0.50 to 11.31 respectively. Principal coordinate analysis showed that the first three components were able to explain a total of 37.12% of the total variance. COMPLET cluster analysis divided 63 studied genotypes into seven groups, which were 8, 13, 7, 3, 3, 13, 16 genotypes, respectively. The accuracy of grouping obtained from cluster analysis was confirmed by the Fisher linear focal detection function with 0.81 percent. Overall, primers UBC822, UBC813, TOS-2 and TOS-1+TOS2 can be introduced as useful and desirable for separation of genotypes and cultivars of hazelnut.}, keywords = {Corylus avellana L,diagnostic function analysis,Cluster Analysis,polymorphic information content}, title_fa = {ارزیابی تنوع ژنتیکی فندق با استفاده از نشانگر ‏ISSR‏ و رتروترانسپوزون در منطقه املش}, abstract_fa = {در این تحقیق تنوع ژنتیکی 63 ژنوتیپ فندق با استفاده از 10 آغازگر ISSR، دو نشانگر رتروترانسپوزون و هفت آغازگر ترکیبی ISSR و رتروترانسپوزون مورد ارزیابی قرار گرفتند که از هفت آغازگر ترکیبی فقط سه آغازگر باندهای واضح و مشخصی را نشان دادند و سایر آغازگرها باندی تشکیل نشد. پانزده آغازگر مورد استفاده در این مطالعه، توانستند در مجموع 116 باند چند شکل  ایجاد کنند. آغازگر UBC822 با تعداد 14 باند بیشترین و آغازگر UBC814 با تعداد 3 باند کمترین تعداد نوار چندشکل را ایجاد کردند. میزان اطلاعات چند شکلی آغازگرها بین 18/0 تا 44/0 و شاخص نشانگر از 50/0 تا 31/11 متغیر بود. تجزیه به مختصات اصلی نشان داد سه مولفه اول توانستند در مجموع 12/37 درصد از واریانس کل را توجیه کنند. تجزیه خوشه‌ای به روش COMPLETE، 63 ژنوتیپ مورد مطالعه را در هفت گروه قرار داد، که به ترتیب در هر گونه 8، 13، 7، 3، 3، 13، 16 ژنوتیپ قرار داده شدند. صحت گروه­بندی حاصل از تجزیه خوشه­ای توسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر با 81 درصد برآورد شد. در مجموع، آغازگرهای UBC822،  UBC813 و Tos2 و ترکیب آغازگر TOS1+TOS2 می‌توانند به‌عنوان آغازگرهای مفید و مطلوب برای تفکیک ژنوتیپ­های فندق معرفی شوند.}, keywords_fa = {تجزیه تابع تشخیص,تجزیه خوشه‌ای,ضریب اطلاعات چندشکلی,‏Corylus avellana L.‎}, url = {https://ijhs.ut.ac.ir/article_88071.html}, eprint = {https://ijhs.ut.ac.ir/article_88071_ef5a224b6bfa62b5612e5cbb3dae55f5.pdf} }